Иридодиагностика - не новый диагностический метод. Он был известен ещё в глубокой древности. Так, в пещерах Малой Азии найдены наскальные изображения радужки и её связей с различными частями человеческого тела. В Индии, Китае больше 3 тыс. лет назад тщательно исследовали органы чувств, причем максимально важными считались изменения, обнаруженные в глазах заболевшего человека. Да не только человека! Пастухи некоторых горных племен больше 800 лет назад определяли заболевания овец по знакам, прочитанным ими на радужке этих животных. В древних папирусах сказано, что этим методом прекрасно владели древние египтяне так же во времена правления фараона Тутанхамона и способствовали широкому распространению иридодиагностики из Египта в Вавилон, Тибет, Индокитай и прочие страны. Знаменитому жрецу фараона Ел Аксу был известен оригинальный способ получения цветных изображений радужки. Цинковые либо никелевые пластины, покрытые особой серебристой жидкостью, он подносил к глазу больного на расстояние 2 см, фиксировал её в течение 4 мин, после чего обрабатывал каким-то реактивом и опять подносил к глазу на 30 с. После специальной обработки на пластинах проявлялось цветное изображение. Такие фотографии дошли до наших дней, впрочем технология их получения неизвестна.
Начало развития современной иридодиагностики было заложено доктором медицины Пекцели. Существует легенда о том, что И. Пекцели заинтересовался иридодиагностикой после происшествия, случившегося с ним в 11-летнем возрасте. Играя на улице - мальчик обратил вниемание пролетавшую возле него сову и тут же загорелся огромным желанием поймать её . Завязалась борьба, которая кончилась тем, что И. Пекцели сломал сове лапу и обнаружил, что в глазу птицы на стороне, соответствующей сломанной лапе, появилась темная полоса. Мальчик взял сову домой и усердно лечил её. По мере заживления лапы бледнела и полоса, превратившаяся к периоду выздоровления совы в небольшое темное пятнышко, окруженное белыми полосками. Это событие оставило неизгладимый след в душе будущего врача. В период обучения в Венском университете, а после чего во время работы в хирургическом госпитале он стал наблюдать за изменением радужки у людей, страдающих различными недугами. При этом он обнаружил, что любому участку тела либо органа соответствует определенный сегмент на радужной оболочке. Собственные многолетние исследования он обобщил и создал первую в мире схему проекционных зон радужки. В 1866 г. И. Пекцели опубликовал книгу, в которой изложил принцип диагностики по радужной оболочке глаза, основное внимание уделяя локализации и форме иридологических знаков.